Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms