Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Traf3ip1Q149C2 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms