Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RpainQ9CWY9 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RpainQ9CWY9 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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