Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Trim12aQ99PQ1 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Trim12aQ99PQ1 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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