Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
NischQ80TM9 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
NischQ80TM9 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms