Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc18Q640L5 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc18Q640L5 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms