Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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