Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Pde6aP27664 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pde6aP27664 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Pde6aP27664 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Pde6aP27664 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Pde6aP27664 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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