Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccl20O89093 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Ccl20O89093 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccl20O89093 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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