Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Spocd1B1ASB6 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms