Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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