Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NipblQ6KCD5 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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