Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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