Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Rnf40Q3U319 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rnf40Q3U319 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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