Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rpusd2Q149F1 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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