Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Cntn3Q07409 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cntn3Q07409 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms