Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd10P28359 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Hoxd10P28359 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd10P28359 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms