Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NefhP19246 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NefhP19246 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NefhP19246 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NefhP19246 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms