Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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