Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt6bQ9Z331 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms