Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Top3bQ9Z321 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms