Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac6Q9Z2V5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac6Q9Z2V5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms