Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tsc22d3Q9Z2S7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms