Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd1Q9Z2E2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms