Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mbd4Q9Z2D7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mbd4Q9Z2D7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms