Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn6Q9Z262 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms