Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VarsQ9Z1Q9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VarsQ9Z1Q9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms