Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngr4Q9Z1L2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms