Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ror1Q9Z139 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ror1Q9Z139 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms