Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Skp2Q9Z0Z3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Skp2Q9Z0Z3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms