Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dctn3Q9Z0Y1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms