Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn9Q9Z0S7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn9Q9Z0S7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn9Q9Z0S7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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