Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clcn5Q9WVD4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clcn5Q9WVD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms