Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scnn1bQ9WU38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 664.3 ms