Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psma4Q9R1P0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms