Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt9Q9R0N9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms