Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms