Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr54Q9R0D8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms