Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npas3Q9QZQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas3Q9QZQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms