Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms