Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pkp3Q9QY23 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms