Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nufip1Q9QXX8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms