Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trp53inp1Q9QXE4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trp53inp1Q9QXE4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms