Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Limd1Q9QXD8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms