Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim44Q9QXA7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim44Q9QXA7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms