Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Homer2Q9QWW1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Homer2Q9QWW1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms