Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tcea2Q9QVN7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms