Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dkk3Q9QUN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dkk3Q9QUN9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms