Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psma6Q9QUM9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms