Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vstm2bQ9JME9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms